El Museu de la Mina és l'espai estrella dins l'oferta museística. Es tracta d'una galeria d'un quilòmetre excavada als peus del Castell de Mequinensa totalment accessible, que explica detalladament tots els sistemes d'explotació de lignit i la maquinària utilitzats a les mines de la localitat al llarg de més d'un segle i mig. Per la seva banda el Museu del Passat Prehistòric recull una selecció de reproduccions a escala d'alguns dels jaciments arqueològics més importants trobats al terme municipal, alguns submergits sota les aigües de l'Ebre.

Al Museu de la Història de Mequinensa es repassa la història del municipi a través de la influència que l'aigua ha tingut per a la població així com el tràgic final del “Poble Vell”, l'antic nucli urbà desaparegut per la construcció de l'embassament de Riba-roja. A més, disposa d'un espai dedicat a la figura de l'escriptor de Mequinensa Jesús Moncada, autor d'obres com “El cafè de la Granota” o “Camí de Sirga”, i d'un espectacular mural de 12 metres de llarg per 2,5 d'alçada on es reprodueix una fotografia de la façana fluvial de la Mequinensa de principis del segle XX.

Els visitants, a més, podran recórrer els carrers del "Poble Vell", lloc on s'organitzen rutes literàries basades en la literatura de Jesús Moncada en les obres de la qual roman viva la memòria col·lectiva de l'antiga Mequinensa, on va néixer i va viure l'escriptor.

Els Museus de Mequinensa formen part de la Xarxa Mundial de Museus de l'Aigua impulsada per la UNESCO, de la Xarxa Ibèrica d'Espais Geominers i de la associació Espais Escrits.