Su gestión se ha incluido dentro de la base de datos del proyecto Interreg Europa, destacando «el uso de las actividades culturales como apoyo al desarrollo» y «la generación de nuevas oportunidades de empleo a través del patrimonio».
El programa Interreg Europe ha seleccionat el projecte dels Museus de Mequinensa com Bona Pràctica a l'àmbit Interreg Europe, per tant a partir d'ara formen part d'aquesta base de dades a nivell europeu que serveix per intercanviar experiències i inspirar la resta de regions a través de la plataforma Policy Learning.
El projecte MOMAr Interreg Europe, del qual els Museus de Mequinensa forma part como stakeholder, té per objecte dissenyar nous models de gestió del patrimoni rural que permetin un desenvolupament sostenible adaptat a cada territori basant-se en experiències d'èxit. Es tracta d'establir col·laboracions en el desenvolupament d'estratègies que permetin engegar accions que millorin la gestió del patrimoni en àrees rurals.
Isabel Soria i Irene Ruiz, tècnics del projecte, ja van visitar anteriorment les instal·lacions dels Museus de Mequinensa per conèixer la gestió que es realitza i determinar si podia servir d'exemple altres territoris com el Comtat de Mehedinti (Romania), l'Agència de Desenvolupament Regional del Sud de Bohèmia (República Txeca), la Província de Groningen (Holanda), la Regió de Sachsen-Anhalt (Alemanya) i la Regió de Còrsega (França) que també participen en el projecte.
Dels Museus de Mequinensa es destaca que ha esdevingut un pol important de l'oferta cultural i turística de la zona conjuntament amb el seu potencial com a eix cultural i artístic i impulsor del desenvolupament econòmic de la localitat i del turisme sostenible. Així mateix, es ressalta com s'ha aprofitat l'oportunitat de futur lligada al patrimoni i la seva importància en la manera de conservar i promoure la memòria del Poble Vell de Mequinensa i de la Conca Carbonífera de Mequinensa.